一、農業部(以下簡稱本部)為避免農會辦理契作硬質玉米購銷作業，發生以進口玉米混充情事，爰訂定繳售查核機制及相關配套措施。
    二、農民繳籽前，應出具種子品種及購買（或取得）來源相關證明(透過農會訂購種子者得免出具證明)，並由鄉（鎮、市、區）農會（以下簡稱農會）登錄於本部農糧署「糧政跨區即時申辦服務作業平台」，始得繳籽。
    三、農會辦理契作硬質玉米購銷作業，應留取農民繳售及農會出售時之硬質玉米籽實(以下簡稱玉米籽實)樣品。
民間烘乾業者(以下簡稱烘乾業者)接受農民委託烘乾或繳售者，應留取農民濕玉米籽實樣品。
農民或烘乾業者未配合辦理留樣作業者，農會應不予收購其玉米籽實。
    四、農會應預為建立硬質玉米烘乾業者名單周知轄內契作農民，並於購銷作業開始前一個月，與烘乾業者簽訂同意配合留樣之合約書，並報請辦理銷售契作硬質玉米作業契作主體及本部農糧署各區分署(以下簡稱分署)備查，倘農會本身為契作主體者，應逕報分署備查。 未簽訂合約書之烘乾業者，農會得不經收其代為烘乾之玉米籽實。
合約書內容應包含烘乾業者代農會收繳玉米地點、雙方應配合濕乾籽留樣之工作事項、玉米籽實收繳規格、違反相關規定之賠償性違約金與懲罰性違約金之計算、應配合政府單位查核等相關條文。
農會應於各期作經收前宣導農民周知留樣作業；並於核定農民可繳交玉米數量通知單上，表明收購留樣措施之文字如下：「請農友繳售玉米時，配合玉米籽實留樣，拒絕留樣者不得繳售契作硬質玉米」。
    五、玉米籽實留樣作業經收端以農民為單位，銷售端以每日出售之廠商為單位，每件樣品至少留取六百公克，並以網袋包裝。經收端玉米籽實留樣作業程序如下：

    (一)繳售玉米籽實者，應於經收過磅後，留取玉米籽實樣品，並由繳交行為人，以及農會(或烘乾業者)人員於留樣簽名單(附件一、二)簽名後，置於留樣網袋內。

    (二)烘乾業者接受農民委託烘乾或繳售者，應將濕玉米籽實留樣樣品送交農會備查，並確實填寫該批玉米所屬農民清冊二份(附件三)，一份留存，一份交由司機於繳交乾玉米籽實時，提交農會併同留樣簽名單置於留樣網袋內。未提供農民清冊者，農會應予拒收。

    (三)農會至農民處載運乾玉米籽實者，應於載運地點逐戶取樣留樣。銷售端辦理玉米籽實留樣作業程序，由廠商提領出貨時，農會應留取乾玉米籽實樣品，並由廠商載運司機及農會人員於留樣簽名單(附件四)簽名後，置於留樣網袋內。

    六、 分署應依下列規定，辦理抽樣送檢作業程序：

    (一)購銷期間應派員並通知契作主體，會同農會辦理抽樣。

    (二)符合下列情形之一者，屬高風險態樣，分署應依鄉鎮（市、區）別，按風險程度就轄內高風險區（者）隨機抽選千分之十二；非高風險區（者）隨機抽選千分之五。

    1.過去三年曾發生非國產玉米混充、國產玉米回流繳售、所繳售玉米非當期申報農地所生產等情形地區之農戶。

    2.透過民間烘乾業者繳交乾籽實之農戶。

    3.接獲檢舉或其他訊息足資判定為可疑之農戶。

    (三)應將所抽選之留樣網袋內玉米籽實分作三份樣品，每份樣品再分封二小樣，裝至夾鏈袋封緊後，逐一編號及造冊(附件五)，並於會封處簽名。另填繕委託檢驗單(附件六)，併同第一份樣品立即寄送本部農糧署指定檢驗機構進行相關檢測；第二份及第三份樣品應保存三個月以上，視後續相關檢測需求作開封送驗。抽樣送檢完成後，其餘未被抽選之樣品，由農會拆封處理。

    七、凡經查獲以非國產玉米混充、國產玉米回流繳售、所繳售玉米非當期申報農地所生產等情形，處理方式如下：

    (一)玉米籽實：該批玉米契作主體不予收購，若於契作主體銷售後始發現，不予補助該部分契作價與銷售價之差額。

    (二)契作獎勵金：當期契作硬質玉米獎勵金不予核發，並停止該等土地申辦各項保價收購、轉（契）作、生產環境維護措施及農業環境基本給付資格一年。若於獎勵金核撥後始發現，本部農糧署得依行政程序法請求申請人返還，並追討相關衍生損失及不當得利。

    (三)涉案人員納入高風險名單加強查核，並得視情節移送司法偵辦。